Esse script faz exatamente isso: você dá uma string e diz o tamanho que quer que ela tenha. O programa preenche o que falta para aquele tamanho com “0″.

#!/usr/bin/python
#-*- encoding: latin-1 -*-

import sys

if len(sys.argv) <=1 :
print “Você deve especificar uma string”
sys.exit(1)
else:
tam = int(sys.argv[2])
name = sys.argv[1]
print name.zfill(tam),